朱棣经过艰苦卓绝的奋斗，终于当上了皇帝。但他要坐稳这个位子，还有很多的事情要做。
朱棣首先找到的是方孝孺，他知道方孝孺名满天下，而且道衍早在他攻下京城之前就对他说过：殿下攻下京城后，方孝孺一定不会投降，但你一定不能杀他!如果杀了他，天下的读书种子就会绝了!有了道衍的警告，朱棣自然不敢怠慢，他希望方孝孺能够为他起草诏书，其实所谓起草诏书找其他人也可以，但如果是方孝孺亲自写的，能够起到安抚天下人心等更好的作用。所以这份诏书非要方孝孺写不可。方孝孺应召而来，并不是给他写诏书的，而是来和他辩论的，或者说是来骂他的。
方孝孺哭着进了大殿，不理朱棣，也不行礼，朱棣十分尴尬，劝说道：“先生不要这样了，我不过是仿照周公辅政而已啊。”这句话激起了方孝孺的愤怒，他应声问道：“成王在哪里?!”“自焚死了。”“成王的儿子呢?!”“国家要年长的君主。”“那成王的弟弟呢?!”“这是我的家事。”朱棣不想再和他废话了，开始逼着方孝孺写，方孝孺写下“燕贼篡位”四字。“你不写，不怕我灭你九族吗?!”“诛我十族又如何!”朱棣这个人，面对他敌人的时候，从来就没有仁慈这一说的。方孝孺的最终结局是：凌迟，灭十族。历史上从来只有九族，朱棣为了凑数，在屠杀的目录中加入了方孝孺的朋友和学生。由于下面的内容过于血腥残暴，我将尽量用简短文言表达，心理承受能力差者可以免观。铁铉，割耳鼻后煮熟，塞入其本人口中，朱棣问：“甘否?”铁铉答：“忠臣孝子之肉，有何不甘!”凌迟，杀其子。黄子澄，凌迟，灭三族。齐秦，凌迟，灭三族。练子宁，凌迟，灭族。卓敬，凌迟，灭族。陈迪，凌迟，杀其子。此外，铁铉妻、女，方孝孺女，齐泰妻，黄子澄妹没入教坊司为妓女。
很多人都据此判断朱棣是一个杀人狂魔，其心狠毒一点不亚于朱元璋，这样的人按理说应该成为一个暴君，老百姓似乎要倒大霉了。但从后来的历史来看，朱棣对老百姓还是很不错的，比杨广和秦始皇要好很多。
为了证明自己是合法的皇帝，而不是大逆不道的反贼，他使用了两个方法：第一、他颁布了一道命令，下令凡是建文帝时代执行的各项规章制度与朱元璋的成例有不同的，全部废除，以老祖宗成法为准，这倒不是因为朱元璋的成法好用。只是朱棣要想获得众人的承认，必须再借用一下死去老爹的威名，表明自己才是真正领悟太祖治国精神的人。第二、他命令属下重新修订《太祖实录》，然后大量篡改实录，如朱元璋生前曾反复训斥朱标和朱允炆，总是一副恨铁不成钢的样子，而对朱棣却总是赞赏有加，一看到朱棣就满面笑容，十分高兴。甚至在他死前，还反复询问朱棣的下落，并有意把皇位传给朱棣。但是由于奸诈的朱允炆等人的阴谋行为，合法的继承人朱棣并没有接到朱元璋的这一指示。于是，本该属于朱棣的皇位被无耻的剥夺了。这些内容读来不禁让人在极度痛恨朱允炆等奸邪小人之余，对朱棣终于能够夺得本就属于自己的皇位感到欣慰，并感叹正义终究取得了胜利，好人是有好报的。当然，朱棣做的这两件事情都没成功，他没有能够欺骗自己，也没有骗到后来的人。但自欺欺人也好，自我安慰也好，毕竟皇位才是最现实的。
建文帝时期，朱棣是藩王，建文帝要削藩，朱棣反对削藩，最后造反，现在朱棣是皇帝了，他也要削藩，那些幸存下来的藩王自然也会反对，但与之前不同的是，他们已经无力造反了。最先被“安置”的是宁王，他被迫跟随朱棣“靖难”，为了换得他的全心支持，朱棣照例也开给了他一张空白支票“事成中分天下”。靖难成功之后，他就把这句话抛在了脑后。宁王朱权也是个明白人，他知道所谓中分天下的诺言绝无兑现的可能，中分他的脑袋倒是很有可能的，于是他很务实的向朱棣提出，北方我不想去了，也不想掌握兵权，希望你能够把我封到苏州，过两天舒服日子。朱棣的回答是不行。那就去钱塘一带吧，那里也不错。还是不行，朱棣再次向他承诺：除了这两个地方，全国任你挑!宁王朱权苦笑道：“还敢再挑么，你看着办吧。”于是，朱权被封到了南昌，这是朱棣为他精心挑选的地方。而被强行发配的朱权的心情想来是不会愉快的，一向争强好胜的他居然被人狠狠地鱼肉了一番，他是绝不会心服的，这种情绪就如同一颗毒芽，在他的心中不断生长，并传给了他的子孙，一直到后来王守仁与后来的宁王朱宸濠大打出手。
永乐四年(1406)五月，削去齐王爵位和官属，八月，废其为庶人。永乐六年(1408)，削去岷王官属及护卫。永乐十年(1412)，削去辽王官属及护卫。永乐十九年(1421)，削去周王护卫。于是，建文帝没有解决的问题终于由他的叔叔朱棣代为解决了。削藩这件建文帝时期第一大事居然是由藩王朱棣最终办成的，这真是一个极大的讽刺。
公元1402年六月十三日，李景隆打开金川门，做了无耻的叛徒，放北军入城，而朱棣却不马上攻击内城，他的目的是等待建文帝自己自杀或者投降，他似乎认为建文帝除了这两条路外，没有别的选择。然而建文帝注定是要和他一生作对的。他选择了第三条路。当扎营于龙江驿的朱棣发现宫城起火时，他十分慌乱，立刻命令士兵进城，救火倒是其次，最重要的是要找一样东西——建文帝，活的死的都行，活要见人!死要见尸!
朱棣十分清楚这件事的利害关系，即使建文帝死了，大不了背一个逼死主君罪名，自己的骂名够多了，不差这一个。活着的话关起来就是了，也不怕他飞上天去。但最可怕的事情就是失踪，皇帝不见了那可就麻烦了。朱允炆毕竟是合法的皇帝，而自己不过是占据了京城而已，全国大部分地方还是效忠于他的，万一他要是溜了出去，找一个地方号召大臣勤王，带兵攻打自己，到时候胜负还真是未知之数。可是怕什么来什么，经过清查，真的没有找到朱允炆的尸体!朱棣急得像热锅上蚂蚁，命令士兵加紧排查，仍然一无所获。这个人又是不能公开寻找的。总不能直接给大臣讲，建文帝不见了，大家赶紧去找，找到了重重有赏吧。为解决这个问题，朱棣想出了一个绝佳的计划，这个计划分两个部分：首先，向外界宣布，建文帝已经于宫内自焚，并找到了尸体，那意思就是所有建文帝的忠臣们，你们就死了这条心吧。其次，派人暗中查访建文帝的下落，具体的查访工作由两个人去做，这两个人寻访的路线也不同，分别是本土和海外。这两个人的名字，一个叫胡濙，另一个叫郑和。
胡濙开始忠实地履行他的职责，他“遍行天下州郡乡邑，隐查建文帝安在”，这期间连自己的母亲死去，他也没有回家探望，而是继续着自己的工作，探寻这个秘密已经成为了他人生的一个重要组成部分。他的努力并没有白费，最终，他找到了答案，在十六年之后。
一代皇帝朱棣的功绩有哪些呢?
朱棣在位期间，也做了很多的大事，虽然后来人都认为这个人心狠手辣，甚至有点心理变态，但又不得不承认他于历史还是做了很多有价值的事。第一件事是修书，“我要修一部古往今来最齐备，最完美、最优秀的书，要让千年之后的人们知道我们这个时代的光辉和荣耀!”他确实做到了，他修成了一部光耀史册，流芳千古的伟大书籍——永乐大典。永乐大典的主编者，是明代第一才子解缙。此书收录上自先秦，下迄明初各种书籍七、八千余种，共计一万一千零九十五册，二万二千八百七十七卷，三亿七千万字。全部由人手一个字一个字地抄写而成。它的内容包括经史子集、天文、地理、阴阳、医术、占卜、释藏、道经、戏剧、工艺、农艺，涵盖了中华民族数千年来的知识财富，它绝不仅仅是 一部书，而是一座中华文明史上的金字塔。更为难得的是，以解缙为首的明代知识分子们以广博的胸怀和兼容并包的思想，采集了几乎所有珍贵的文化资料，为我们留下了一笔巨大的财富。朱棣的梦想终于实现了，他郑重的为这部伟大的巨作命名——《永乐大典》。
朱棣所做的另一件影响深远的事情就是迁都，而迁都这种事情无论在哪个朝代都是一件大事。朱棣的这次迁都无疑是对后世影响最大的一次。今天的北京拥有上千万人口，无数的高楼大厦，是我们国家的首都，也是世界上最繁华的城市之一，而这一切的起点就源自于朱棣的一个决定。
永乐九年(公元1411年)，朱棣命令工部尚书宋礼治理会通河，以保证河道的畅通，宋礼是一个很有能力的水利专家，他完成了任务，此后漕运总督陈瑄进一步疏通了河道，从此南北漕运畅通无阻，所谓“南极江口，北尽大通桥，运道三千余里”，粮食问题最终得到了解决。而迁都的其他工作也一直在紧张地进行之中，中央各部门的办公单位早在永乐七年(1409)就已经修好，而京城的建设工作于永乐十五年开始，一直进行了三十余年才结束。眼见机会成熟，朱棣于永乐十九年(公元1421年)正式下令：迁都!
原先的京师改名为南京，北京作为明帝国新的都城被确定下来，从此北京这个城市正式成为了明朝首都，并一直延续了二百余年，但它的历史却并未随着明朝的灭亡而结束，相反，它一直富有生气的存在和发展着，并最终成为世界上最有影响力的城市之一。
朱棣在建设北京时，是有着相当的现代意识的，他十分注意城市的整体规划，分别修建了数条主线和支线，把北京市区规划成形状整齐的方块，并制定了严厉的规定，禁止乱搭乱盖，还铺设了完整的下水道系统。
而现在我们看到的故宫和天坛等北京著名建筑，都是朱棣时代打下的基础(此后清朝曾经整修过)。特别值得一提的是故宫，它占地十七万平方米，征用无数劳力，用了二十年完成，它原先只是供皇帝居住的地方，老百姓绝对与之无缘，也没有买票参观这一说，但这并不能影响它在历史上的地位。现在故宫已作为中华民族的历史瑰宝成为我们每个中国人的骄傲。无可否认，这正是朱棣的功绩，不能也无法抹煞。值得一提的是，当年的迁都决不是一帆风顺，众人响应的，实际上，根本没有几个人赞成朱棣的这一决策。“你们都不要再说了，迁都是我做的决定，一定要迁，我说了算，就这么办了!”朱棣迁都的行为招致了当时众人的反对，很多人也断言此举必不可行，但十九年后站在北京城头遥望远方的于谦应该不会这样想。历史才是事物发展最终的判断者，在不久之后，它将毫无疑问地告诉每一个人：朱棣的抉择是正确的。
接下来朱棣做的这件事就家喻户晓了，就是派郑和下西洋，朱棣安排郑和出海是有着深层次目的的，除了寻找建文帝外，郑和还肩负着威服四海，胸怀远人的使命，这大致也可以算是中国历史上的老传统，但凡强盛的朝代，必定会有这样的一些举动，如汉朝时候贯通东西的丝绸之路，唐朝时众多发展中国家及不发达国家留学生来到我国学习先进的科学文化技术，都是这一传统的表现。中国强盛，万国景仰，这大概就是历来皇帝们最大的梦想。他历经坎坷，九死一生，终于实现了这一中国历史乃至世界历史上伟大的壮举，他率领庞大船队七下西洋，促进了明朝和东南亚、印度、非洲等国的和平交流，并向他们展示了一个强大、开明的国家的真实面貌。虽然他的个人生活是不幸的，也没有能够享受到夫妻之情和天伦之乐。但他却用自己的行动为我们留下了一段传奇，一段中国人的海上传奇。
在靖难之战后七年，朱棣再次披上了盔甲，拿起了战刀，准备走上战场去击败他的敌人蒙古人，与之前的那次战争之不同的是，上一次他是皇子，这一次他是皇帝，上一次是为了皇位，这一次是为了国家。八年未经战阵的朱棣终于回到了战场，一切似乎都是那么的熟悉，在他看来，江南水乡的秀丽和宁静远远比不上北方草原的辽阔与豪迈。丝竹之音、轻柔吴语对他没有多少吸引力，万马嘶鸣、号角嘹亮才是他的最爱!这就是朱棣，一个沉迷于战场搏杀，陶醉于金戈铁马的朱棣，一个真正而彻底的战士。朱棣率领着他的大军不断向北方挺进，当军队经过大伯颜山时，朱棣纵马登上山顶，远望大漠，唯见万里黄沙，极尽萧条，二十年前，他曾经远征经过此地，那一年他三十岁，这里还有很多人家，是繁华之地，如今却变成了一片荒漠。朱棣感叹良多，对身边的大臣说道：“元兴盛之时，这里都是民居之地啊。”战胜敌人后，朱棣正在马上俯视着这片刚刚经过大战的土地，大风吹拂着一望无际的草原，斡难河水在阳光的照耀下，映出迷人的光彩，刚发生的那场恶战似乎与这片美丽的土地毫无关系。胜利喜悦已经消退的朱棣突然想起了什么，他沉思了一会，对身边的侍卫感叹道：“这里是斡难河，是成吉思汗兴起的地方啊。”
两百年前，就在斡难河畔，铁木真统一了蒙古部落，成为了伟大的成吉思汗，术赤、窝阔台、拖雷、哲别等后来威震欧亚大陆的名将们环绕在他的周围，宣誓向他效忠。之后他们各自出征，将自己的宝剑指向了世界的各个角落，并最终建立了横跨欧亚的蒙古帝国。转眼之间，两百年过去了，草原上的大风仍旧呼啸，斡难河水依然流淌，但那雄伟的帝国早已不见了踪影，而就在不久之前，伟大的成吉思汗的子孙在这里被打得落荒而逃。一切都过去了，只有那辽阔的草原和奔流的河水似乎在向后人叙说着这里当年的盛况。百年皇图霸业，过眼烟云耳!
